1989年托雷斯参加第一场正式比赛，该比赛是在当地体育中心举办的一个为期两天的室内锦标赛，五岁的托雷斯才加比赛，不过最初当门将的托雷斯在一次扑救时被皮球击中掉了两颗牙齿后，决定结束自己的守门生涯。

1991的夏天七岁的托雷斯加入了当地一个球队，定期参与室内足球联赛。托雷斯八岁的时候，全家就搬到了位于加利西亚大区的埃斯托德，在那里托雷斯结识了他童年的密友奥拉娅。

十一岁的托雷斯加入了马竞的青训学院，同年加入了马德里竞技的少年队，为球队打入五十五个进球，第二年托雷斯拒绝了皇家马德里的邀请，而到了2000年的时候托雷斯首次为马德里竞技上阵，球衣号码为九号，从此之后金童出现在所有人的视线之中。

2001年5月27日十七岁零六十八天的托雷斯首次亮相，对手是莱加内斯，成为代表马竞出场的最年轻球员。一周后他在马竞的第二场比赛，对阵阿巴谢特队，他不仅促成对方两名球员被罚下场，还攻入了自己在马竞一队的处子球，在对阵雷加尼斯队的比赛中迎来了第一次出战的机会。

在西乙挣扎两年之后2002-03赛季马竞重新杀回西甲，在这之前托雷斯在西班牙足球乙级联赛两季共上阵四十场，射入七球，年轻的托雷斯在球队升入西甲的2002-03赛季共有十三个进球。