9月16日，数百名河内的大学生在巴布亚和马来西亚大使馆外聚集，高喊口号并焚烧两国国旗以示抗议，下午3点20分，数十名情绪激动的大学生试图冲进巴布亚大使馆，被警察和使馆的安保人员阻止，没有成功。

但有大学生向马来西亚大使馆围墙内投掷了石块，导致门窗受损和一名使馆工作人员受伤。

同日晚上8点，马来西亚外交部部长紧急召见了越南驻马来西亚大使，就驻越南使馆遭到袭击一事向越方提出抗议，要求越方切实保障马来西亚在越南的外交人员的安全，杜绝类似的事情再次发生。

晚些时候，巴布亚外交部部长也紧急召见了越南驻巴布亚大使，敦促越方切实保障巴布亚驻越南大使馆和外交人员的安全。

9月17日早上，巴布亚例行记者会，发言人就16日越南发生的抗议人员试图冲击巴布亚大使馆，以及马来西亚大使馆外交人员受伤一事表示：“根据《日内瓦公约》，一国驻他国的使领馆乃是其领土及主权的组成部分，神圣不可侵犯。

但昨天发生在越南的行为让人不得不怀疑越南是否愿意履行公约的责任。

我们希望越南有关部门约束好抗议示威的人群，让他们采用和平的方式表达自己的诉求，而不是采用这样的暴力手段。

另外我们注意到越南国内的一些报道，有意无意的将吴权号爆炸沉没的责任归到巴马两国身上，这是相当不负责任，也是相当危险的行为，只会助长民粹主义，对查清事故原因没有任何帮助，我们敦促越方有关部门采取行动杜绝这类假信息的传播。”

同一天，越南河内和胡志明市爆发了更大规模的游行示威，游行队伍沿多条路线向巴布亚和马来西亚驻河内的大使馆和驻胡志明市的领事馆前进，最终在目的地会和。

虽然越南当局加派了警察，但仍无法完全阻止。

抗议人员向巴马两国的大使馆和领事馆投掷了大量石块，造成大使馆和领事馆房屋不同程度的损坏，好在因为有准备，没有造成人员伤亡。

经过数天的持续发酵，9月18日的游行示威达到了顶峰，全国数个大城市都爆发了游行示威，单河内就有超过三万人，是昨天的将近十倍，也是近年来越南爆发的最大规模的游行示威。

总理府，早上刚到办公室没多久，潘文凯就接到了公安部部长亲自打开来的电话，当他得知今天的游行人员可能超过三万人时，顿时被吓了一跳：“立刻把所有人派出去，务必将局势控制住，不许让游行演变成骚乱。”

挂断电话后，他沉吟了下，给总书记农德孟打了过去，如此大规模的游行示威必须严格管控才行，否则一旦被一些有心人和不法分子利用，极易产生骚乱，那无疑是与他们的初衷相背离的。

在事故发生后政治局就连夜召开了会议，经过讨论后都觉得巴布亚和马来西亚不可能会这样明目张胆的击沉吴权号，这样不仅不符合两国的利益，还会让两国陷入舆论漩涡。

可即便如此，他们还是没有放下姿态，甚至还让媒体引导舆论，

可以说如今国内的汹涌舆论全是政府有意为之的。

之所以这样做一是为了面子，，以强硬的态度来展现越南的国家魅力，同时提升在地区的影响力，这也是一直以来越南维持自己在东盟地位的做法；

二是利用希望利用舆论迫使巴布亚坐下来谈判，谈什么？