同时登陆后的幕府正规军，开始兵分三路进军，东路为幕府第二军右副将：加藤清正，从尚庆左道庆州府釜山蒲出发取道去庆州府闻庆郡、中路为幕府第一军左副将：小西行长，从尚庆右道密阳郡出发同样北上去尚庆左道庆州府闻庆郡，和东路军会合，后进军忠清左道忠州牧，以图攻占京畿右道汉城府王城。

西路为幕府第三军福冈国藩主：黑田长政，从尚庆右道金海郡出发，也会师于尚庆左道庆州府闻庆郡，后越过天险秋山岭，进入京畿右道汉城府王城。

4月15日，明兵部尚书：石星，又命明宁远伯：李成梁，长子明山西总镇总兵：李如松，提督陕西承宣布政使司军务，统兵讨伐叛将哱拜。

随后又命明延绥总镇总兵：董一奎、明榆林卫总兵：李蕡、明宁夏卫总镇副总兵：萧如薰、明大同总镇总兵：麻贵，一起向哱拜叛军发动进攻。

此后又命新任的明宁夏巡抚兼都察院左佥都御史：朱正色、明甘肃总镇巡抚兼都察院左都御史：叶梦熊，至军中协助明山西总镇总兵兼陕西提督：李如松，地方上的军务。

4月18日，明固原卫总镇副总兵：李昫，领兵与前任明宁夏卫总镇总兵兼陕西都指挥佥事：牛秉忠，抵达宁夏卫总镇城下，而明神宗又下令提拔明延绥总镇总兵：董一奎，为主帅，明榆林卫总兵：李蕡，为副帅。

同时东路战线李氏朝鲜方面，朝、幕，在庆尚右道尚州牧，进行「尚州会战」，幕府第一军左副将大破李氏朝鲜庆尚道都指挥使：李建，占据庆尚右道。

接着明神宗：朱翊钧，就提拔明宁夏卫总镇副总兵：董如薰，代替明延绥总镇总兵：董一奎，为主帅，在以明大同总镇总兵：麻贵，代替明榆林卫总兵：李蕡，为副帅。

可还没有等他们到，明固原卫总镇副总兵：李昫，就已经开始攻城了。

叛贼从东西两个门，各出骁勇善战的骑兵三千人迎战，步兵排列战车为阵营，明军步兵以及火铳队冲锋上来，夺得战车百辆，以明军骑兵乘胜追击，将叛军逼入洛浦河内，叛军淹死者不计其数。

其中以明延绥总镇副总兵：王通，作战尤其卖力，他的家丁明延绥总镇右参将：高益，等乘胜进入北门，后因援兵没到而被杀死，明延绥总镇副总兵也身负重伤，明榆林卫游击将军：俞尚德，则力战而死。

次日，叛将宁夏卫总镇右副总兵：许朝、叛将宁夏卫总镇右参将：土文秀，闯入宁夏卫境内的庆亲王府，打退了庆亲王府护卫指挥使司、庆亲王府仪卫司，俘虏了明庆宪亲王：朱伸域，占领庆亲王府劫掠财物。

而明庆宪亲王妃：方氏，连忙将明庆宪亲王世子：朱帅锌，藏在地窖中，再自杀身亡保存名节，使得明庆宪亲王世子得以保命。

之后就胁迫明庆宪亲王登上东城，乞求城外明军暂时罢兵，还诈称愿意献出首倡叛乱者的脑袋。

此时正好明军大营的粮食吃完了，便领兵退去，在附近城堡就地扎营休整。