10月初7日，后金天聪汗便致书给明辽东总镇总兵：祖大寿、明辽东都指挥同知：何可纲、明宁远卫右参将：张存仁、明广宁左屯卫指挥使：祖大弼、明广宁右屯卫总兵：祖大成，等将领们劝其速来投降，但仍遭到了主帅祖总镇总兵的拒绝。

于是后金天聪汗又亲自写信给祖总镇总兵，他还解释道“女真语：过去我军斩杀辽民确有其事，本汗深为懊悔，如今本汗早就下令不那样做了，至于永平府屠城一事，乃是二贝勒：爱新觉罗·阿敏，所为他也因此受到了严惩，希望祖总镇总兵大人不要存在此偏见。”

话虽如此但祖总镇总兵等将领们，却还是不信，为此后金天聪汗还让俘虏的明将连带姻亲关系的前去劝降，但无一例外都失败了。

同时回到朝中的明将：黑云龙，当即就被官复原职，还被询问关于后金的情报，如揭发李氏朝鲜王国与后金往来密切，向后金提供大量战略物资的情况，并促使大明对李氏朝鲜王国实行贸易封锁，又建议朝廷在边境草木茂盛处烧荒，对骑兵为主的敌军起到了一定的遏制效果。

10月初9日，后金天聪汗又派明降将：姜新，赶赴城中面谈，明辽东总镇总兵则派出明广宁中左守御千户：韩栋，来到了后金军营中谈判。

同时面对逃出去回到山海卫的明广宁中屯卫总兵：吴襄，地方官员上报朝廷，明毅宗崇祯帝：朱由检，认为吴总兵救援不利，且提前撤退导致全军覆没，被抓下狱。

至于其二子明宁远卫标统：吴三桂，却因救父有功，被加封为〈宁远卫游击将军〉。

10月24日，在登州卫衙门内，由于此次派遣北上援辽的登莱两府明军地位，都远远高于东江镇与皮岛部明军，再加上负责率军出征的明东江镇坐营左参将：沈世魁，不甘心臣服于辽东镇军阀明东江总镇总兵：黄龙，麾下。

因此故意克扣军饷，还把罪名推给黄总镇总兵头上，又加上援辽军队也就东江镇与皮岛本部装备待遇最差。

这很快就引起了东江镇与皮岛部明军将领们的不满，恰巧这时明东江镇水营左参将：李梅，又在军里搞起了走私活动，以补充军饷物资。

当即就被明东江总镇总兵将其打入大牢内，但是这个李参将却是明登州卫中军左参将：耿仲明，的亲信两人关系非常好，而明登州卫中军左参将弟弟明皮岛步兵都司：耿仲裕，又恰好在东江镇军队里任职。

他得知消息后为了救哥哥好友李参将，便写信给哥哥耿参将，而他就指使弟弟耿都司，以索要军饷为名，趁机起兵包围了黄总镇总兵东江镇衙门，并将他绑了起来，押到演武场上批斗。

还让他跪下，准备下令割掉他的耳朵和鼻子，甚至拔刀怒骂，看起来要杀了他一样，左右身边的将领们发现情况不对劲，连忙上前阻拦，并说道“耿都司大人，咱们只是要问黄总镇总兵索要军饷，眼下以绑住，弟兄们也开仓取得粮饷了，没必要在赶尽杀绝，更何况是黄总镇总兵还是朝廷任命的武将，又是辽东都指挥使司孙督师的部将，若贸然斩杀了，恐怕朝廷方面也不好交代。”

于是明东江总镇总兵就这样捡回一条性命，并被士兵松绑搀扶着走下去，而李参将也被人从牢里放出来，换成了黄总镇总兵下狱。

因此明东江镇坐营左参将：沈世魁，便站出来出谋划策，也让带头闹事的明皮岛步兵都司：耿仲裕、明金州守御千户所前锋千总：王应元，等人觉得是时候推举出一个带头者了。