关键时刻就连以勇毅闻名的满清镶白旗固山额真：钮钴禄·图尔格、弟弟满清镶白旗梅勒章京：钮钴禄·伊尔登、满清工部承政：爱新觉罗·锡翰、满清正白旗奉国将军：爱新觉罗·额克亲、满清镶黄旗牛录章京：钮钴禄·遏必隆，等清军将领们见无法以格斗取胜，情急之下只能占据御营寨门拼命放箭，将明东协总兵及其部下射伤。

很快清军八旗们已从混乱中反应过来，开始从四面八方向御营内集合，而曹总兵因失血过多几近昏厥！此时若有援军相助，那么明军定能反败为胜突出重围，可见满蒙联军也不是强无敌，只可惜明军将领个个贪生怕死只知逃跑！

眼下见杀入东虏建奴鞑子酋长（指满清太宗）中军帐无望后，曹总兵只得率军退回松山堡修养。

事后让满清太宗非常震怒，满清各大将领皆被处分罚银，并加强了御营周边的防御。

9月26日，卫拉特蒙古和硕特部固始汗：孛儿只斤·图鲁拜唬，发兵攻打藏巴汗：噶玛丹迥旺波，先占领卫藏大部分地区，迫使藏巴汗率领残部退守到后俄力思军民元帅府地区。

而卫拉特蒙古和硕特部固始汗则乘胜进军，并占领了藏巴汗的府邸沙鲁万户府。

10月12日，西班牙哈布斯堡王朝驻军决定加强防御，由西班牙哈布斯堡王朝圣萨尔瓦多城长官：波提罗，违背西班牙哈布斯堡王朝驻马尼拉总督：科奎拉，的指示。

重建可以俯瞰圣萨尔瓦多城的撤守堡，以免日后尼德兰军队从此地，居高临下炮击主城，但这也引起了尼德兰军队的重视。

12月20日，明毅宗信王崇祯帝：朱由检，敕令内臣十二监四司八局宦官们，不得干预朝政，并戒谕廷臣们说道“朝廷分职，原是宫府不同，臣子守官，岂容暗奸作弊，况析圭儋爵之义，宜无私交，而防微杜渐之闲，尤先近侍，无奈世风日降，士乞遂靡，虽奉公守法者固多，而行险侥幸者亦有，妩媚交欢，势权嫟就，为阿大夫之借誉，左右扫门，有路可通，无径而走，窥探泄漏，视为固然，以后内外大小诸臣，如再蹈前辙，宪典具在，朕不敢私。”

明崇祯十五年公元1642年正月初8日，巴达维亚的尼德兰王国荷属东印度公司再以，尼德兰王国荷属东印度公司驻巴达维亚中校：拉莫提，为统帅增援大员（台湾府）。

不过当地的尼德兰王国荷属东印度公司驻大员总督：保罗·杜拉弟纽司，担心夏季海风结束前，援军无法抵达大员，遂派遣尼德兰王国荷属东印度少校：哈鲁斯，带了396名尼德兰士兵再次进攻，这就是第二次圣萨尔瓦多城战役。

此时尼德兰军队已经有了重武器，所以能攻城如虎添翼，导致西班牙哈布斯堡王朝驻军总共阵亡6位士兵，损毁2台加农炮，彻底放弃抵抗，双方开始协商。

正月26日，经过商议之后西班牙哈布斯堡王朝驻军开城投降，从此西班牙哈布斯堡王朝控制台湾府北部的历史结束，还被尼德兰军队送到巴达维亚囚禁。

2月18日，满清太宗见围困已久便再次下令满蒙联军炮轰松山堡，城内明军依旧顽强抵抗，明毅宗还派遣明顺天府巡抚：杨绳武，督师军队北上救援明蓟辽总督：洪承畴，但明顺天府巡抚却走到顺天府玉田县就病死了。

无奈之下明毅宗只得又派明兵部右侍郎：范志完，领兵北上救援，又以明山海卫左参将：焦埏，出山海卫协助。